Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FXNQ16595 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FXNQ16595 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FXNQ16595 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FXNQ16595 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FXNQ16595 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FXNQ16595 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FXNQ16595 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FXNQ16595 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FXNQ16595 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FXNQ16595 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FXNQ16595 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FXNQ16595 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FXNQ16595 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FXNQ16595 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FXNQ16595 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FXNQ16595 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FXNQ16595 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FXNQ16595 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FXNQ16595 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FXNQ16595 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FXNQ16595 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FXNQ16595 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FXNQ16595 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FXNQ16595 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FXNQ16595 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FXNQ16595 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FXNQ16595 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FXNQ16595 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FXNQ16595 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FXNQ16595 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FXNQ16595 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FXNQ16595 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FXNQ16595 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FXNQ16595 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FXNQ16595 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FXNQ16595 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FXNQ16595 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FXNQ16595 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FXNQ16595 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FXNQ16595 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FXNQ16595 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FXNQ16595 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FXNQ16595 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FXNQ16595 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FXNQ16595 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FXNQ16595 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FXNQ16595 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FXNQ16595 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FXNQ16595 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FXNQ16595 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FXNQ16595 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FXNQ16595 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FXNQ16595 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FXNQ16595 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FXNQ16595 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FXNQ16595 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FXNQ16595 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXNQ16595 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXNQ16595 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXNQ16595 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXNQ16595 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXNQ16595 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FXNQ16595 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXNQ16595 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FXNQ16595 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FXNQ16595 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FXNQ16595 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FXNQ16595 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FXNQ16595 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FXNQ16595 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FXNQ16595 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FXNQ16595 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FXNQ16595 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FXNQ16595 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FXNQ16595 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FXNQ16595 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FXNQ16595 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FXNQ16595 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FXNQ16595 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXNQ16595 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXNQ16595 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXNQ16595 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXNQ16595 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXNQ16595 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXNQ16595 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXNQ16595 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FXNQ16595 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FXNQ16595 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FXNQ16595 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FXNQ16595 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FXNQ16595 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FXNQ16595 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FXNQ16595 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FXNQ16595 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FXNQ16595 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FXNQ16595 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXNQ16595 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXNQ16595 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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