Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR1Q16570 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms