Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1CQ15572 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1CQ15572 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF1CQ15572 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF1CQ15572 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF1CQ15572 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
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