Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRKQ15262 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PTPRKQ15262 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PTPRKQ15262 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRKQ15262 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRKQ15262 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
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