Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
EEA1Q15075 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
EEA1Q15075 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.57■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
EEA1Q15075 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
EEA1Q15075 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms