Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX17Q15036 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNX17Q15036 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX17Q15036 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX17Q15036 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX17Q15036 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
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SNX17Q15036 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
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SNX17Q15036 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX17Q15036 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX17Q15036 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX17Q15036 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNX17Q15036 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
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SNX17Q15036 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX17Q15036 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX17Q15036 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX17Q15036 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX17Q15036 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX17Q15036 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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SNX17Q15036 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SNX17Q15036 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX17Q15036 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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