Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAM2Q15035 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAM2Q15035 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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