Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1I3Q14994 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1I3Q14994 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1I3Q14994 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1I3Q14994 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1I3Q14994 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1I3Q14994 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NR1I3Q14994 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NR1I3Q14994 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NR1I3Q14994 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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