Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHD4Q14839 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHD4Q14839 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHD4Q14839 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CHD4Q14839 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
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