Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF3Q14653 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF3Q14653 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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