Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BECN1Q14457 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BECN1Q14457 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
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BECN1Q14457 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
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BECN1Q14457 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BECN1Q14457 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
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BECN1Q14457 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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BECN1Q14457 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
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BECN1Q14457 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
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BECN1Q14457 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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BECN1Q14457 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BECN1Q14457 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
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