Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM25Q14258 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM25Q14258 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM25Q14258 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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