Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF9Q13886 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF9Q13886 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLF9Q13886 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLF9Q13886 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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