Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBA3CQ13748 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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