Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PDE3BQ13370 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PDE3BQ13370 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDE3BQ13370 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PDE3BQ13370 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE3BQ13370 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
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