Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLF1Q13351 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLF1Q13351 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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