Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 46.6
PABPC4Q13310 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 DLGAP5-201ENST00000247191 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-224ENST00000534802 1999 ntTSL 221.26■□□□□ 0.999e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.59e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.389e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-215ENST00000528173 5737 ntTSL 517.02■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 CFAP20-203ENST00000562622 1605 ntTSL 516.47■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.039e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-208ENST00000524984 3512 ntTSL 214.39□□□□□ -0.119e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-211ENST00000527211 3679 ntTSL 1 (best)13.51□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 CDK5-202ENST00000469108 582 ntTSL 326.81■■□□□ 1.883e-6■■■■■ 46.1
PABPC4Q13310 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.723e-6■■■■■ 46.1
PABPC4Q13310 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.693e-6■■■■■ 46.1
PABPC4Q13310 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 46.1
PABPC4Q13310 IMP4-210ENST00000462392 1793 ntTSL 322.94■■□□□ 1.267e-7■■■■■ 46
PABPC4Q13310 IMP4-208ENST00000460766 2379 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.27e-7■■■■■ 46
PABPC4Q13310 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.63e-15■■■■■ 45.9
PABPC4Q13310 PRCC-202ENST00000454659 1084 ntTSL 316.97■□□□□ 0.313e-15■■■■■ 45.9
PABPC4Q13310 PRCC-204ENST00000469071 1969 ntTSL 212.25□□□□□ -0.453e-15■■■■■ 45.9
PABPC4Q13310 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 RPL28-211ENST00000560881 1692 ntTSL 519.65■□□□□ 0.741e-323■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.591e-323■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-323■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 ADD2-210ENST00000456320 997 ntTSL 518■□□□□ 0.477e-9■■■■■ 45.7
PABPC4Q13310 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 45.7
PABPC4Q13310 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.557e-9■■■■■ 45.7
PABPC4Q13310 ADD2-214ENST00000522886 874 ntTSL 510.67□□□□□ -0.77e-9■■■■■ 45.7
PABPC4Q13310 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.165e-12■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.215e-12■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.469e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 AC073896.1-203ENST00000548360 512 ntTSL 423.2■■□□□ 1.39e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 AC073896.1-202ENST00000547423 566 ntTSL 421.88■■□□□ 1.099e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.079e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 CNPY2-212ENST00000553191 621 ntTSL 26.99□□□□□ -1.299e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.191e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.311e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-207ENST00000451538 546 ntTSL 59.63□□□□□ -0.871e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-208ENST00000454323 688 ntTSL 36.84□□□□□ -1.311e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-212ENST00000497715 2400 ntTSL 25.73□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.541e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.781e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.881e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RETSAT-205ENST00000449375 1759 ntTSL 517.27■□□□□ 0.356e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 BAIAP2-222ENST00000575841 509 ntTSL 214.72□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RETSAT-203ENST00000429806 2335 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RETSAT-204ENST00000438611 1500 ntTSL 512.95□□□□□ -0.346e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RETSAT-201ENST00000295802 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.666e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 320.92■□□□□ 0.943e-11■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 219.64■□□□□ 0.733e-11■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 SYPL1-207ENST00000634737 835 ntTSL 57.39□□□□□ -1.233e-25■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.273e-25■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 SYPL1-204ENST00000464029 1017 ntTSL 26.36□□□□□ -1.393e-25■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 SYPL1-203ENST00000460770 545 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.793e-25■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 CHCHD6-205ENST00000510044 670 ntTSL 221.09■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 CHCHD6-203ENST00000504973 562 ntTSL 319.79■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.281e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 AP002748.4-201ENST00000419755 3547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.741e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 COX5B-204ENST00000494306 738 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-30■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 PACSIN3-209ENST00000532457 1845 ntTSL 525.09■■□□□ 1.618e-7■■■■■ 45.2
PABPC4Q13310 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.388e-7■■■■■ 45.2
PABPC4Q13310 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 45.2
PABPC4Q13310 PACSIN3-210ENST00000533686 443 ntTSL 319.37■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 45.2
PABPC4Q13310 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.424e-9■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 LAMTOR4-208ENST00000474831 564 ntTSL 316.42■□□□□ 0.224e-9■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.394e-9■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-207ENST00000443708 1724 ntTSL 519.37■□□□□ 0.699e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.689e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.659e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-212ENST00000463664 1922 ntTSL 518.07■□□□□ 0.489e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-202ENST00000423070 1887 ntTSL 516.63■□□□□ 0.259e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.169e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-218ENST00000493560 1963 ntTSL 515.18■□□□□ 0.029e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-206ENST00000427977 1611 ntTSL 514.97□□□□□ -0.019e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-214ENST00000470345 2128 ntTSL 214.13□□□□□ -0.159e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-216ENST00000474352 2840 ntTSL 213.37□□□□□ -0.279e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-209ENST00000455397 1521 ntTSL 512.85□□□□□ -0.359e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.975e-22■■■■■ 45
PABPC4Q13310 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.595e-22■■■■■ 45
PABPC4Q13310 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 45
PABPC4Q13310 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.016e-46■■■■■ 44.8
PABPC4Q13310 PPP5C-213ENST00000527623 1215 ntTSL 224.84■■□□□ 1.579e-28■■■■■ 44.8
PABPC4Q13310 C21orf59-206ENST00000440966 1082 ntTSL 322.83■■□□□ 1.251e-10■■■■■ 44.5
PABPC4Q13310 C21orf59-202ENST00000300260 1243 ntTSL 221.28■■□□□ 11e-10■■■■■ 44.5
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 301.7 ms