Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCGB2A2Q13296 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SCGB2A2Q13296 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms