Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAMF1Q13291 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLAMF1Q13291 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLAMF1Q13291 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms