Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
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