Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
PRDM2Q13029 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRDM2Q13029 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
PRDM2Q13029 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PRDM2Q13029 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PRDM2Q13029 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC42.62■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PRDM2Q13029 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PRDM2Q13029 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
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