Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF3Q12996 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF3Q12996 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSTF3Q12996 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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