Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN13Q12923 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN13Q12923 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN13Q12923 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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