Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB40BQ12829 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB40BQ12829 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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RAB40BQ12829 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB40BQ12829 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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