Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
FAAP100Q0VG06 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAAP100Q0VG06 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAAP100Q0VG06 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAAP100Q0VG06 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAAP100Q0VG06 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms