Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC173Q0VFZ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC173Q0VFZ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC173Q0VFZ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms