Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF543Q08ER8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF543Q08ER8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF543Q08ER8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF543Q08ER8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms