Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGM3Q08188 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGM3Q08188 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TGM3Q08188 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms