Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN1BQ07699 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN1BQ07699 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms