Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CXCL9Q07325 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CXCL9Q07325 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CXCL9Q07325 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CXCL9Q07325 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CXCL9Q07325 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms