Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK18Q07002 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK18Q07002 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK18Q07002 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK18Q07002 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms