Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMX2Q04743 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EMX2Q04743 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMX2Q04743 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMX2Q04743 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
EMX2Q04743 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EMX2Q04743 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms