Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBE1Q04446 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBE1Q04446 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBE1Q04446 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GBE1Q04446 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms