Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MUC3AQ02505 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MUC3AQ02505 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MUC3AQ02505 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC3AQ02505 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms