Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SATB1Q01826 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SATB1Q01826 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms