Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFAP4Q01664 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TFAP4Q01664 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TFAP4Q01664 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFAP4Q01664 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFAP4Q01664 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms