Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DEFA6Q01524 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DEFA6Q01524 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DEFA6Q01524 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms