Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1Q01196 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RUNX1Q01196 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms