Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCN7AQ01118 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCN7AQ01118 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
SCN7AQ01118 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCN7AQ01118 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms