Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F1Q01094 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F1Q01094 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F1Q01094 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F1Q01094 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms