Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRCDQ00LT1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRCDQ00LT1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRCDQ00LT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms