Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSBP2P81877 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP2P81877 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSBP2P81877 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms