Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K9P80192 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K9P80192 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K9P80192 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K9P80192 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K9P80192 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K9P80192 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K9P80192 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K9P80192 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K9P80192 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K9P80192 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MAP3K9P80192 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MAP3K9P80192 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MAP3K9P80192 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MAP3K9P80192 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MAP3K9P80192 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MAP3K9P80192 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MAP3K9P80192 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1340.4 ms