Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NTHL1P78549 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTHL1P78549 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NTHL1P78549 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms