Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PIP4K2BP78356 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PIP4K2BP78356 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PIP4K2BP78356 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PIP4K2BP78356 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PIP4K2BP78356 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms