Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOMO3P69849 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOMO3P69849 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NOMO3P69849 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOMO3P69849 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms