Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RPS29P62273 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RPS29P62273 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RPS29P62273 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RPS29P62273 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RPS29P62273 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RPS29P62273 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RPS29P62273 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RPS29P62273 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RPS29P62273 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RPS29P62273 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RPS29P62273 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RPS29P62273 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RPS29P62273 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RPS29P62273 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RPS29P62273 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RPS29P62273 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RPS29P62273 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPS29P62273 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RPS29P62273 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPS29P62273 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPS29P62273 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPS29P62273 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPS29P62273 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPS29P62273 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPS29P62273 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS29P62273 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS29P62273 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS29P62273 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS29P62273 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS29P62273 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS29P62273 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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