Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCE1P61221 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCE1P61221 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCE1P61221 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms