Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WNT3AP56704 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
WNT3AP56704 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WNT3AP56704 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
WNT3AP56704 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT3AP56704 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT3AP56704 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms