Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3BP55884 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3BP55884 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3BP55884 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3BP55884 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms